Potensi perikanan pasca tangkap Kota Pekalongan berupa berbagai jenis olahan ikan antara lain pengasinan, pemindangan, pengasapan, ikan segar dan produk nilai tambah. Seiring dengan menurunnya produksi bahan baku ikan yang berasal dari perikanan tangkap, produk olahan ikan juga mengalami penurunan. Namun dalam kurun waktu tiga tahun terakhir (2011 - 2013) semua jenis produk olahan mengalami peningkatan yang cukup signifikan.
Potensi pelaku usaha perikanan pasca tangkap di Kota Pekalongan saat ini seperti terlihat pada tabel berikut